¿Por qué la profundidad de la secuenciación de ADN de alto rendimiento y cuántos metros es la secuenciación de ARN?
Debido a la especificidad espacio-temporal y temporal de la expresión del ARN, el número de expresiones de ARN en diferentes tejidos en diferentes momentos o al mismo tiempo es muy diferente, por lo que no podemos hablar de la cantidad de secuenciación de ARN. datos, basta con expresarlos mediante la profundidad de secuenciación. Generalmente, cuando hablamos de secuenciación de ARN, hablaremos de cuántos grupos medimos, que son las moléculas de ARN interrumpidas. Por ejemplo, una determinada muestra de ARN utiliza un grupo de 30 M (30 millones) para la secuenciación, utilizando tecnología de secuenciación de doble extremo, es decir, cada grupo se prueba desde ambos extremos y cada prueba es de 150 pb, por lo que el número de lecturas será de 30 M* 2 = 60 M, entonces el número de lecturas multiplicado por la longitud de cada lectura es nuestro volumen de datos de secuenciación final (número de bases), que es 60 M * 150 = 9 G de bases.