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El surgimiento de las academias en la dinastía Song comenzó cuando Fan Zhongyan estaba a cargo y Du Nanfu Xue estaba a cargo. Especialmente después del New Deal de Qingli, floreció en la dinastía Song del Norte. En ese momento, había cuatro colegios. Las cuatro academias famosas en China son la Academia Bailudong en Lushan, Jiangxi, la Academia Yuelu en Changsha, Hunan, la Academia Songyang en Dengfeng, Henan y la Academia Yingtianfu en Shangqiu, Henan. Se hizo más próspera durante la dinastía Song del Sur, bajo los auspicios del confucianismo, y se convirtió en la Academia Neoconfuciana.
El sistema académico en la dinastía Yuan era más próspero, centrándose en el estudio de Zhu Cheng y consagrando los estudios de la dinastía Song. A principios de la dinastía Ming, la academia decayó hasta que Wang Yangming salió y prosperó nuevamente. Posteriormente, la academia se convirtió en un tabú por sus críticas a la situación actual. Tanto Sejong como Zhang destruyeron academias, especialmente el incidente de la Academia Donglin. Wei Zhongxian destruyó todas las academias del mundo y las academias disminuyeron enormemente.
Cuando la dinastía Qing entró en China, todavía tenían temores persistentes sobre la vitalidad de las academias y continuaron suprimiéndolas. En el undécimo año de Yongzheng (1733), varias provincias establecieron formalmente academias, lo que cambió la actitud de aliento y las academias gradualmente se hicieron populares. Pero ya fueran oficiales o privados, todos estaban supervisados por el gobierno y ya no había libertad para enseñar en las dinastías Song y Yuan.