Diferencias en los finales de los cómics Yu-Gi-Oh gx

El final del manga Yu-Gi-Oh GX es completamente diferente al final de la animación. La relación entre ambos es solo que usan el mismo escenario de misión. El manga puede continuar durante varios años. una vez completada la animación.

El final de "Yu-Gi-Oh GX", Yujo Judai VS Muto Yugi terminó en empate, sin ganador. Judai viajó a la época en que Muto Yugi todavía era un adolescente y tuvo un verdadero duelo de graduación con Yugi, quien tenía la Carta de Dios. En ese momento, Judai recuperó algo importante que había perdido en los tres años de lucha continua. Judai convocó al "Hombre Nuevo", y Yugi también convocó al "Mago Negro". El feroz duelo comenzó y el resultado final fue un empate.

El autor del manga Yu-Gi-Oh GX no es el señor Takahashi Kazuki, sino Naoyuki Kageyama, uno de sus aprendices. Fue serializado en "V-jump" de Shueisha de 2005 a 2011.